二零二零年年初，本港爆发2019冠状病毒病。在疫症蔓延，人心虚怯之际，惩教人员仍处变不惊，充分发挥对社会的使命感，义不容辞出心献力，帮助社会度过难关。

二零二零年一月初，有报导指内地出现一种具传染性病毒，并有蔓延迹象。根据二零零三年处理「沙士」所得的经验，署方估计政府部门对口罩的需求可能急增，于是早著先机，在一月初已调动内部资源提升口罩产量，并开始加班生产口罩。与此同时，署方亦开始购买额外口罩生产机器及原材料以应付急增的需求。

其后，疫情日益严峻，市面上口罩短缺。为此，署方采取主动，积极研究各个增加口罩产量的方案。最后决定打破常规，安排罗湖惩教所口罩工场破天荒24小时运作，并征集现职和退休惩教人员以及文职人员担任义工制造口罩。这羣现职及退休人员满腔热诚，无私付出，希望各尽一分力，协助香港战胜疫情。一众义工合共工作逾40 000小时，超过2 500人次参与，口罩生产量为每月400多万个。

二零二零年四月，有见及市面上的儿童口罩供应紧绌，本署发挥香港人灵活变通的精神，迅即把一条半自动生产线改装成生产儿童口罩。署方随后亦于赤柱监狱及东头惩教所增设过滤口罩生产线，进一步提高口罩生产量。自二零二零年一月初起，署方已将口罩生产量由以往每月平均约110万个，增加至最高峰时的每月约540万个，以解各政府部门和学校口罩不足的困境。

这次疫情揭示本港缺乏本地生产的个人防护装备，有见及此，本署即时向政府提出建议，建立「个人防护装备生产基地」，于罗湖惩教所及大榄惩教所设立新的生产线生产保护衣、保护帽和保护面罩等个人防护装备。此举不仅为政府的防疫工作提供强大后盾，并可培养在囚人士的社会责任感，让他们有机会为巩固本地公营医疗体系出一分力。

即使疫情来势汹汹，但爱群义工团关爱社群之心却丝毫不减。他们一如以往，竭诚服务不同社群。二零二零年，爱群义工团主要参与的活动包括于罗湖惩教所进行的口罩生产义工计划，超过2 500名团员参与。此外，虽然有些义工服务受疫情影响不得不延后或取消，但在可行情况下，义工团仍参与各项防疫义工活动，包括包装及派发口罩予基层市民和长者、探访长者及向他们派发抗疫福袋，并分享抗疫资讯。

二零一九年，香港持续发生大规模的暴乱事件。在社会纷扰之际，部分惩教人员本着对社会的使命感，挺身而出，自愿成为首批特别任务警察，跨越平常执勤的围墙，在院所以外协助警方守护香港。首批特别任务警察于二零一九年十一月正式执勤，他们主要来自惩教署区域应变队，职责包括守卫政府处所、协助防暴行动及处理突发事件等。随后，其他纪律部队人员亦陆续加入成为特别任务警察，协助维持治安，让香港社会早日回复安宁。