行政及策劃
行政組 會計組 整合科技組 工程及策劃組 公共關係及對外事務組 統計及研究組
行政及策劃處由一名首長級丙級政務官掌管，包括以下各組別：行政組、會計組、整合科技組、工程及策劃組、公共關係及對外事務組和統計及研究組。
公共關係小組舉辦記者招待會及簡報會，讓市民了解覊管和更生安排。
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行政組
部門行政分組負責為本署總部和懲教院所提供行政及後勤支援，包括資源、環保、檔案和樓宇管理，以及負責部門約500名一般及共通職系人員的職系管理事宜。
人事分組負責處理約6 900名職員的人事事宜，包括薪酬和津貼、假期和旅費、房屋福利、僱員補償及終止聘用。該分組亦負責在電腦系統內存備人事檔案及薪酬記錄。
聘任分組處理招聘和晉升選拔工作。二零一五年，有關工作為數約35項。本署通過公開招聘，全年聘用了約310名公務員。
編制分組負責一切編制事宜，包括開設及刪除職位，為運作需要臨時調配職位，並為部門編制委員會提供秘書服務。
內部核數分組負責視察各院所的財政及物料供應事宜，確保有關人員遵從政府所定的規例及程序。
翻譯分組負責為部門提供中英文翻譯服務，以及批核院所為在囚人士安排非法定語文及方言的翻譯及傳譯服務。
中央物料供應分組監管所有與採購、供應、物料及設備有關的行政和財務事宜。二零一四至一五年度的全年採購總開支如下：
院所物品和設備 — 6,293萬元；
在囚人士衣服 — 1,543萬元；
職員制服 — 710萬元。
部門行政分組負責為本署總部和懲教院所提供行政及後勤支援，包括資源、環保、檔案和樓宇管理。
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會計組
會計組包括部門會計組、管理會計組和工業會計組，共同負責涵蓋懲教工業的所有財政及會計工作。
本署在二零一五年的總開支為36.84億元（不包括建設工程費用），較二零一四年增加12%。開支增加主要由於個人薪酬開支上升所致。從各項來源所得的全年總收入為6 800萬元，其中5 800萬元來自職員宿舍租金。
懲教署工業組暫記帳內的訂購和收款總額分別為1.23億元和1.22億元。
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整合科技組
整合科技組包括電子行動組和電子行政組，為部門的日常運作提供資訊科技支援。在保安局資訊科技管理組的協助下，整合科技組亦負責策劃、統籌和推行各項資訊科技項目及電子政府措施，以提高部門的運作效率。
電子行動組專責處理網絡系統的發展，以及管理與行動有關的資訊科技計劃和服刑資料管理系統。電子行政組則負責管理行政方面的電腦系統和計劃項目，以及維護部門互聯網網站和內聯網系統。
二零一五年，本署因應二零一三年所訂立的未來五年資訊系統策略計劃完成了兩項可行性研究。其中一項研究的目的是全面加強部門資訊科技的基礎建設，而另一項則是集中於設立一個系統以綜合懲教及更生管理，進一步改善部門長遠運作效率。
除了提供日常的資訊科技應用支援外，整合科技組亦透過研究整合不同科技的可行性，致力提升部門運作效率和善用資訊科技的資源。在二零一五年二月，整合科技組推出一項流動應用程式，讓部門更有效率地對外發放資訊。該流動應用程式可方便市民透過預先登記取得在囚人士的探訪狀況、以及瀏覽部門的職位空缺和接收相關信息提示服務等資訊。
整合科技組為部門的日常運作提供資訊科技支援。
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工程及策劃組
工程及策劃組負責與建築署及機電工程署共同計劃興建新懲教院所及翻新現有的陳舊懲教設施。二零一五年完成的主要工程項目包括屯門屯富路紀律部隊宿舍重建計劃。
進行中的大型工程有大欖女懲教所的原址局部重建計劃。規劃中的項目包括興建懲教署總部大樓、香港仔田灣的職員宿舍重建計劃、 更換及提升赤柱監獄的閉路電視系統，以及在大欖女懲教所裝置電鎖保安系統。
二零一五年，我們進行多項小規模建造工程，例如擴建赤柱監獄的廚房、更換壁屋懲教所、石壁監獄及荔枝角收押所的閉路電視監察系統，在院所展開數碼地面電視接收工程、改善大欖懲教所探訪設施、在喜靈洲興建中央探訪室大樓，以及改善院所閉路電視系統的數碼錄像系統等。規劃中的項目還有更換赤柱監獄廣播系統及在喜靈洲興建中央行政區。
本署繼續改善成年在囚人士的職業訓練設施，推動在院所採用省電照明系統和可再生能源科技的設施。此外，本署改善院所的吸煙間、消防系統、探訪室設施及旗桿的工程均進展順利。
本署一些規模較小的改善和維修工程，均有在囚人士參與。此舉除了讓他們在羈管期間培養良好的工作習慣，並為他們提供機會接受職業訓練，從而協助他們改過自新和重新融入社會。
原址局部重建計劃下建成的大欖女懲教所綜合大樓。
在囚人士在大欖女懲教所新建的運動場散步。
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公共關係及對外事務組
公共關係及對外事務組負責為部門積極推行對外聯絡和公共關係策略的工作。
對外事務小組負責統籌本地與內地和海外司法管轄區懲教機構的互訪和專業交流活動。二零一五年，小組繼續安排政府新聞處「貴賓訪港計劃」的訪客參觀懲教設施，讓他們更加了解本署的羈管和更生工作。除了內地和海外的訪客，對外事務小組亦安排正在就讀與香港司法制度和懲教工作相關課程之本地大學生參觀懲教設施，加深學生對懲教工作的了解。
鑑於近年非本地在囚人口有所增加，對外事務小組與駐港外國領事館保持定期接觸和緊密聯繫，並安排領事館人員參觀懲教院所。
對外事務小組亦會統籌聯絡主任訓練課程，安排有潛質的職員參與專業禮賓訓練，為參加部門大型活動和來訪的團體及賓客，提供聯絡和接待的服務，以提升部門的形象。
公共關係小組負責向傳媒發放有關本署各項計劃、服務和活動的消息，通過向傳媒全面提供相關資料，可讓更多市民得知本署提供的羈管工作及更生安排的最新情況。
公共關係小組亦處理新聞界的查詢，發放新聞稿，籌辦新聞發布會和記者招待會，安排傳媒與懲教署人員會面及參觀懲教院所。
二零一五年，公共關係小組委託公司拍攝了最新部門影片「同一樣的使命，非一般的任務」以及製作數部短片，介紹部門更生工作和活動，上載懲教署Youtube頻道。
此外，該小組亦協助製作宣傳物品，電視、電台的政府宣傳聲帶和短片。該小組亦負責本署年報及《愛羣》月刊的編製工作。
對外事務組與駐港外國領事館保持定期接觸和聯繫，在二零一五年安排領事館人員參觀赤柱監獄。
公共關係組在二零一五年安排傳媒參觀羅湖懲教所。
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統計及研究組
統計及研究組負責就部門運作和懲教計劃的策略規劃、監察和檢討，提供統計資料和研究支援。
除編製統計報告以應付部門的管理及規劃需要外，該組亦收集有關在囚人口的社會經濟和犯罪背景特徵的統計數字，以及定期更新在囚人口的推算數字，為日後的需要作出評估。該組亦協助研究罪犯在入獄前的吸毒情況、在囚期間的自殘行為、暴力行為和違反紀律行為、及本地罪犯在獲釋後的再犯罪情況，以期盡量提升懲教治療、懲教行動和行政工作的成效。該組所提供的研究支援有助制訂政策和其他相關工作。
