行政及策劃
行政及策劃處由一名首長級丙級政務官掌管，包括以下各組別：行政組、會計組、整合科技組、資訊科技管理組、工程及策劃組、公共關係及對外事務組、媒體傳訊組和統計組。
改善設施
大部分懲教院所已有數十年歷史。為了與時並進，懲教署一直與建築署及機電工程署緊密合作，因應個別院所的設計及保安考慮，採取切實可行的措施，逐步優化院所內的設施。
為加快緊急支援、加強院所保安及提升管理效率，署方獲立法會通過撥款，在高度設防院所（包括赤柱監獄、壁屋懲教所、石壁監獄、小欖精神病治療中心和大欖女懲教所（非重建範圍））的大部分通道、囚室和相關設施陸續安裝「電鎖保安系統」，以電動柵欄式閘門取代舊式手動機械鎖開關閘門。截至二零二一年年底，大欖女懲教所（非重建範圍）的工程項目已經順利完成，而赤柱監獄及石壁監獄的工程項目則仍在進行，餘下兩間院所的工程項目亦會陸續展開。
此外，懲教署亦會陸續為院所更換數碼閉路電視系統，並研究在系統中加入體溫探測功能，以確保羈管環境安全和協助監測在囚人士的健康狀況。預計工程完成後，可進一步提高懲教院所的保安水平及有效減低病毒在院所內傳播的風險。
懲教署在年內採取了多項措施改善羈押環境，包括改善院所的空氣流通情況。除恆常更換風扇外，亦加裝風力較強的牛角扇及具防自殺設計的滾筒扇，並循序漸進地安裝通風效能較佳的新式閘門及窗戶，力求改善空氣流通問題。
加強數據應用
除了優化懲教設施及應用新科技以精簡工作程序外，懲教署亦持續為各項重要工作制訂指標及定期編製統計數據，以檢視院所的管理情況及評估各項更生計劃的成效。署方亦正籌建一個綜合數據平台，以匯集不同資訊系統的數據，供管理人員作分析和研究之用。此外，懲教署積極參與政府的開放數據計劃。自二零一九年起，署方向公眾發布了30項有關懲教工作的統計數據。
宣傳推廣
本署的公共關係組以多種形式向市民發放部門的新聞及資訊，包括向傳媒發放新聞稿和圖片、處理傳媒查詢、舉行記者會，以及安排傳媒訪問、採訪及參觀等。另外，該組亦不時更新部門的宣傳影片，以及負責製作年報及部門刊物《愛羣》月刊，讓市民了解署方的工作及最新發展。
懲教署於二零一八年成立媒體傳訊組，以創新的拍攝手法和充滿創意的故事大綱製作了多部短片，藉此加深公眾對懲教工作的認識，並向青少年和社會推廣更生信息和正面的價值觀。二零二零年和二零二一年，署方製作的短片在多個國際大賽合共奪得26個獎項；另外亦通過面書專頁，發布各種題材的帖文和資訊，向市民大眾（尤其是青年人）分享懲教工作和相關的資訊。
曾參與黑暴的青少年在囚人士接受傳媒訪問，希望通過分享自身經歷，告誡青年人三思而後行。
懲教署推出以「智慧創未來」為標題的全新部門影片，介紹部門的主要工作及最新發展。
懲教署製作的短片在多個國際大賽奪得獎項。
新懲教總部大樓
為配合懲教署未來的發展和運作需要，署方已於二零二一年第一季展開位於柴灣盛泰道的懲教署總部大樓工程，預計於二零二四年第四季完工。懲教署計劃把現時分布在不同地區的主要辦公室和設施一併遷往總部大樓，以提升協調能力和運作效率，有利於部門長遠發展。